由于咳嗽是许多疾病的一种非特异性症状，临床上进行确诊时除了详细询问病史以外还需要做一些辅助检查，主要有实验室检查和影像学检查，以排除一些可以引起慢性、顽固性咳嗽的其它疾病。

　　1、实验室检查

　　痰中发现支气管管型、肺石、硫黄颗料等分别对肺炎球菌肺炎、肺结核和肺放线菌病有帮助;痰在显微镜下检查发现库施曼螺旋体，夏兰晶体对支气管哮喘症患者有帮助;痰中发现寄生虫卵可诊断肺吸虫病;发现包囊虫的棘球蚴的头可诊断肺包囊虫病;找到阿米巴滋养体可诊断肺阿米巴病等。

　　痰的细菌学检查对肺结核、肺真菌病等有重要意义，痰中发现癌细胞能明确支气管肺癌的诊断。结核菌素试验对淋巴结结核有一定的意义。

　　2、影像学检查

　　由于肺脏有良好的天然对比，普通的X线摄片能检查出多数的肺部病灶，根据病灶的部位、范围和形态有时也可确定其性质，如肺炎、肺脓肿、肺囊肿、肺结核、肺癌、尘肺等。对深部的病变则用X线摄片，CT、MRI检查，CT扫描的优越性在于横断面图像无影像重叠，能够发现X线胸片未能显示的病灶。

　　支气管造影可直接诊断支气管扩张的部位、形态，也可直接诊断支气管肺癌，膈疝患者须用钡餐检查加以确诊。支气管镜可以诊断支气管内异物、支气管内膜结核、支气管肿瘤;纵隔镜可以帮助诊断纵隔肿瘤和发现纵隔淋巴肿大。镓扫描在肺部炎症病灶和结节冰现呈阳性，故不能作为监别肺癌与肺炎病灶和结节病的手段。